Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms