Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWQ1

Trbv23, T cell receptor beta, variable V23 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Trbv23A0A0A6YWQ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trbv23A0A0A6YWQ1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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