Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WQ19

Gm28171, Predicted gene 28171, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28171A0A087WQ19 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm28171A0A087WQ19 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm28171A0A087WQ19 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms