Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WP28

Gm28510, Predicted gene 28510, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28510A0A087WP28 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm28510A0A087WP28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm28510A0A087WP28 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms