Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Fmo4-201ENSMUST00000028014 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sectm1a-202ENSMUST00000100126 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14676-201ENSMUST00000117722 858 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rpsa-ps11-201ENSMUST00000118446 889 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 E330010L02Rik-201ENSMUST00000136639 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 9230117E06Rik-201ENSMUST00000159309 497 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm15749-201ENSMUST00000161848 612 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mir5114-201ENSMUST00000175574 61 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm8391-201ENSMUST00000185632 726 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm37218-201ENSMUST00000192917 390 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm42915-201ENSMUST00000197478 323 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm8992-201ENSMUST00000204463 502 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29725-201ENSMUST00000206614 407 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm44744-201ENSMUST00000208234 852 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm45584-201ENSMUST00000211586 1143 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC114645.2-201ENSMUST00000214308 791 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm18745-201ENSMUST00000216018 548 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Olfr1415-201ENSMUST00000071521 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mir195a-201ENSMUST00000083477 94 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ssr3-202ENSMUST00000119896 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 AC124426.1-201ENSMUST00000220871 2707 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Rfc4-203ENSMUST00000115338 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm14437-201ENSMUST00000152284 360 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 4930573I07Rik-202ENSMUST00000199120 413 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cxcr1-201ENSMUST00000053389 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 2700029L08Rik-201ENSMUST00000202895 1465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm43290-201ENSMUST00000200359 1557 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm19001-201ENSMUST00000222736 1651 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Ddias-201ENSMUST00000032877 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Mepe-201ENSMUST00000066207 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Prdx3-201ENSMUST00000025961 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a3Q9JLI2 Romo1-204ENSMUST00000119950 379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms