Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm8206-203ENSMUST00000171428 997 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 1110015O18Rik-201ENSMUST00000183632 570 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm8607-201ENSMUST00000221864 431 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm43747-201ENSMUST00000201412 1330 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm17134-201ENSMUST00000166593 437 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Otud1Q9CUB6 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm42723-201ENSMUST00000199966 1044 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Olfr926-201ENSMUST00000078289 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Otud1Q9CUB6 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
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