Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Nt5c1b-203ENSMUST00000143739 1570 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ppip5k1-203ENSMUST00000110626 5171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ift172-201ENSMUST00000041565 5403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Dpy19l2-201ENSMUST00000133010 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Pkd1l3-203ENSMUST00000212537 6576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sept6-201ENSMUST00000053456 4673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ptgs2os2-201ENSMUST00000181308 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Tnr-201ENSMUST00000111669 4424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Atg16l1Q8C0J2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Togaram2-201ENSMUST00000097284 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Olfr1328-201ENSMUST00000081960 944 ntAPPRIS P2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Atg16l1Q8C0J2 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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