Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm43110-201ENSMUST00000198877 226 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Trav4-1-201ENSMUST00000199078 330 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Arl15-202ENSMUST00000224068 1002 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Bbs7-201ENSMUST00000040148 2599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Etfbkmt-204ENSMUST00000111551 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Etfbkmt-201ENSMUST00000047531 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Cep19-203ENSMUST00000169186 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm44198-201ENSMUST00000203063 2636 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm15033-201ENSMUST00000118188 673 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm5459-201ENSMUST00000171235 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tmem147-207ENSMUST00000209065 727 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Calb2-202ENSMUST00000212297 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 1700109K24Rik-202ENSMUST00000227532 1030 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Olfr96-201ENSMUST00000078209 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Scnn1a-207ENSMUST00000177329 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Katna1-202ENSMUST00000165806 1775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Katna1-201ENSMUST00000019929 1774 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Birc3-202ENSMUST00000115672 2909 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Prpf39-201ENSMUST00000120580 4069 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm19173-201ENSMUST00000204494 1523 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Glns-ps1-201ENSMUST00000120291 1118 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm15777-201ENSMUST00000123463 876 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm16058-201ENSMUST00000124392 427 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm16104-201ENSMUST00000156260 401 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm28180-201ENSMUST00000189608 722 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm37118-201ENSMUST00000194328 406 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm36569-201ENSMUST00000195082 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ucma-205ENSMUST00000195688 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm18780-201ENSMUST00000209594 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm19045-201ENSMUST00000222488 1193 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC133598.3-207ENSMUST00000225918 704 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Pdzk1ip1-201ENSMUST00000030488 1119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm43165-201ENSMUST00000200842 1635 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Rorb-202ENSMUST00000112828 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Drc3-203ENSMUST00000108722 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm12774-201ENSMUST00000117881 416 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm12529-201ENSMUST00000119529 268 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Tnni1-208ENSMUST00000154463 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp54Q8BL06 Ints5-203ENSMUST00000191089 568 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms