Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nr1h4-201ENSMUST00000058126 1964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Txk-203ENSMUST00000197313 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 A430105I19Rik-201ENSMUST00000059997 4703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tbp-203ENSMUST00000118001 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dkk2-201ENSMUST00000029665 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 4930517L18Rik-201ENSMUST00000191880 482 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Uspl1-202ENSMUST00000100410 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms