Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Adcy7-201ENSMUST00000098521 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-201ENSMUST00000032811 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rasgrp4-202ENSMUST00000094617 4617 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cers3-201ENSMUST00000066475 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm8083-201ENSMUST00000203976 475 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC119177.2-201ENSMUST00000226699 629 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Il6st-210ENSMUST00000184949 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Decr1-201ENSMUST00000029877 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Zfp958-202ENSMUST00000202692 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm15482-201ENSMUST00000152691 4529 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Limk1-202ENSMUST00000111233 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
H2-Eb1P04230 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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