Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Kat7-204ENSMUST00000107733 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Daam1-201ENSMUST00000085299 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Lrrk2-201ENSMUST00000060642 8275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Fkbp15-201ENSMUST00000084527 4264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
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