Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm42979-201ENSMUST00000196287 2228 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pygm-202ENSMUST00000113483 2583 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm38245-201ENSMUST00000191702 2621 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Osmr-204ENSMUST00000176826 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ccnb2-ps-202ENSMUST00000170898 2296 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Abcc3-206ENSMUST00000178136 5005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zfp677-201ENSMUST00000056107 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Myo7a-202ENSMUST00000107122 6867 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp5-202ENSMUST00000125200 3300 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pde2a-204ENSMUST00000209537 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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