Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm11736-201ENSMUST00000121468 505 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ddx3x-201ENSMUST00000000804 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ptgds-201ENSMUST00000015234 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Mettl8-204ENSMUST00000112186 2347 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Serpina3m-201ENSMUST00000101078 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Serpina3m-202ENSMUST00000168797 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm46218-202ENSMUST00000215520 1956 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ido2-201ENSMUST00000121992 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Ctsa-201ENSMUST00000017904 3674 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Fundc1Q9DB70 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fundc1Q9DB70 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Fundc1Q9DB70 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms