Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm37257-201ENSMUST00000194871 717 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms