Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 AC130671.3-201ENSMUST00000227393 1897 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm12207-201ENSMUST00000143016 494 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm14341-201ENSMUST00000154616 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Psme1-208ENSMUST00000174259 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Proca1-202ENSMUST00000078099 1254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Srp14-201ENSMUST00000009693 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mblac2-201ENSMUST00000057598 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Mcm3-201ENSMUST00000053266 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Usp16Q99LG0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp16Q99LG0 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Usp16Q99LG0 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Acvr1-203ENSMUST00000112599 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Ndn-201ENSMUST00000038775 3694 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Olfr30-202ENSMUST00000215691 2404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Pax5-202ENSMUST00000102932 1460 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Gm12733-201ENSMUST00000119871 767 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Usp16Q99LG0 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms