Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9S1

Atmin, ATM interactor, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtminQ6P9S1 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 C330027C09Rik-202ENSMUST00000117994 3977 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Atxn7l1-203ENSMUST00000110824 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Dnajc14-202ENSMUST00000217745 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
AtminQ6P9S1 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Ube4bos3-201ENSMUST00000155845 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Vmn2r-ps9-201ENSMUST00000177446 1099 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
AtminQ6P9S1 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms