Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37032-201ENSMUST00000194882 2975 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Ccdc40-202ENSMUST00000053440 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm43086-201ENSMUST00000202536 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Acta2-201ENSMUST00000039631 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm45072-201ENSMUST00000208673 929 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Skap2Q3UND0 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 B930082K07Rik-201ENSMUST00000181046 2478 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm38413-202ENSMUST00000198449 2348 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Mcm5-201ENSMUST00000164309 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Fxr1-208ENSMUST00000200392 3014 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Skap2Q3UND0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms