Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gba-201ENSMUST00000077367 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm12326-201ENSMUST00000132986 618 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm29346-201ENSMUST00000188147 255 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ndufa4-205ENSMUST00000204978 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 AC107752.1-201ENSMUST00000219362 469 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 4932430I15Rik-201ENSMUST00000180431 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 6030469F06Rik-202ENSMUST00000218473 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sox8Q04886 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Sox8Q04886 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Sirpa-201ENSMUST00000049262 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Calr4-201ENSMUST00000030285 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sox8Q04886 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
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