Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm21969-201ENSMUST00000178644 4402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Vmn1r213-204ENSMUST00000228758 5975 ntAPPRIS P2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tor1aip2-204ENSMUST00000111754 2491 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Champ1-201ENSMUST00000051870 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Kng1-202ENSMUST00000039492 1985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Rapgef6-203ENSMUST00000102743 8189 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Sun5-201ENSMUST00000028982 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Slc45a3-202ENSMUST00000177943 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Foxm1-201ENSMUST00000073316 4652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Calr4-204ENSMUST00000106631 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Slc16a5-202ENSMUST00000106532 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Smg7-202ENSMUST00000073441 5767 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tulp4-209ENSMUST00000149756 8784 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mfsd11-201ENSMUST00000021173 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Adgrf3-201ENSMUST00000088117 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zscan21-203ENSMUST00000110959 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hmgb4-201ENSMUST00000053830 746 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms