Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Ugt1a9-201ENSMUST00000073772 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 P2rx2-206ENSMUST00000200214 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm24335-201ENSMUST00000104211 132 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Prkar1a-202ENSMUST00000106676 962 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Mup9-201ENSMUST00000107506 721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Mup9-207ENSMUST00000132829 598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Alg14-204ENSMUST00000199554 441 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Olfr1393-201ENSMUST00000078932 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Mup11-201ENSMUST00000084544 601 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Mup16-201ENSMUST00000095051 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gsta1-201ENSMUST00000098537 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Bnip3-201ENSMUST00000106112 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Eif3l-201ENSMUST00000040518 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm24432-201ENSMUST00000104075 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm22609-201ENSMUST00000158286 121 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Pax4-205ENSMUST00000174194 974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Gm33815-205ENSMUST00000195574 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Mark4-ps-201ENSMUST00000196140 384 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 AC134869.4-201ENSMUST00000224724 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Pla2g4c-ps-201ENSMUST00000204668 1364 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chd1P40201 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Crp-201ENSMUST00000038495 1695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Camk2a-202ENSMUST00000039904 1734 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Rbm26-204ENSMUST00000163545 3270 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chd1P40201 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AU019990-202ENSMUST00000143964 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tmem267-204ENSMUST00000178948 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 AC140299.1-201ENSMUST00000217855 1510 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Trdv2-1-201ENSMUST00000103677 345 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Rpl9-ps3-201ENSMUST00000119147 576 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 n-R5s175-201ENSMUST00000122599 117 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm15635-201ENSMUST00000127834 371 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Chd1P40201 Gm13402-201ENSMUST00000153600 424 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm13997-201ENSMUST00000155641 336 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm45134-201ENSMUST00000206046 1189 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 n-R5s74-201ENSMUST00000082654 116 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Mir212-201ENSMUST00000083656 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Arhgap10-203ENSMUST00000210922 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Mfap5-207ENSMUST00000148517 1506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Tmem144-202ENSMUST00000168038 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm12019-201ENSMUST00000121258 532 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Banf2os-202ENSMUST00000145504 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Prss28-201ENSMUST00000015267 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm14174-201ENSMUST00000153158 161 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm2939-201ENSMUST00000198496 478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm7434-201ENSMUST00000208558 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm30196-201ENSMUST00000208957 160 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm1979-201ENSMUST00000168875 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Chd1P40201 Gm29326-201ENSMUST00000185541 2451 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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