Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pus7l-201ENSMUST00000049151 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Colq-205ENSMUST00000150054 2867 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Zfp398-202ENSMUST00000114598 8328 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Lpin1-201ENSMUST00000067124 5581 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Copa-206ENSMUST00000135192 4622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Opalin-201ENSMUST00000087176 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Adam6a-201ENSMUST00000053086 2558 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Fblim1-203ENSMUST00000105785 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Ins2-202ENSMUST00000105930 583 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
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Ccl20O89093 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Ccl20O89093 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
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