Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Zfp185-201ENSMUST00000114546 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm38340-201ENSMUST00000195039 4008 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pld1-202ENSMUST00000120834 4849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Fam124b-201ENSMUST00000058748 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 1600029O15Rik-202ENSMUST00000179787 1809 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Csf1r-201ENSMUST00000025523 3870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm30414-201ENSMUST00000194886 2596 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Lsm6-203ENSMUST00000130325 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Cntln-203ENSMUST00000107190 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm35394-201ENSMUST00000196434 3252 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Plekho2-201ENSMUST00000068944 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Bcas3-206ENSMUST00000108062 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ankdd1b-201ENSMUST00000055607 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Gm9955Q8CEJ8 Cd300e-201ENSMUST00000062787 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Card11-201ENSMUST00000085786 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Tnfrsf8-201ENSMUST00000030339 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Coro7-201ENSMUST00000038552 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm42765-202ENSMUST00000200017 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm17816-201ENSMUST00000219991 2603 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Gm9955Q8CEJ8 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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