Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm11662-201ENSMUST00000121389 1193 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm18513-201ENSMUST00000177313 560 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC158531.1-201ENSMUST00000224617 457 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 1700010B08Rik-201ENSMUST00000073081 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rnase11-201ENSMUST00000076106 713 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm6028-201ENSMUST00000077111 574 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Eda2r-202ENSMUST00000113832 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Vgll3-202ENSMUST00000227997 1383 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm35618-201ENSMUST00000223164 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm8310-201ENSMUST00000117526 1193 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm2694-209ENSMUST00000210935 1125 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm11567-201ENSMUST00000078442 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Ly6g6c-203ENSMUST00000174876 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 2900045O20Rik-201ENSMUST00000218374 1292 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm5951-201ENSMUST00000220283 504 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tceanc2-203ENSMUST00000058585 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gprc5d-201ENSMUST00000032327 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TrioQ0KL02 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 4933431E20Rik-205ENSMUST00000137970 795 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 2610042L04Rik-202ENSMUST00000165466 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 2410141K09Rik-204ENSMUST00000173583 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm6967-201ENSMUST00000182599 1007 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Spin3-ps-201ENSMUST00000192825 770 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm17815-201ENSMUST00000198305 895 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Numb-210ENSMUST00000154043 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 A430078G23Rik-201ENSMUST00000098966 2945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm25232-201ENSMUST00000104502 132 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm12248-201ENSMUST00000137124 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm7337-201ENSMUST00000180954 1125 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Ly6c1-205ENSMUST00000187347 522 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm36973-201ENSMUST00000193942 259 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Polr1d-204ENSMUST00000200993 1167 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm18471-201ENSMUST00000208272 452 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Pcdhb4-201ENSMUST00000056712 3718 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Hsd11b1-205ENSMUST00000161737 1355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 C030014I23Rik-204ENSMUST00000217463 1370 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Tmem267-204ENSMUST00000178948 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Nt5c1b-211ENSMUST00000218339 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Nt5c1b-201ENSMUST00000002456 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
TrioQ0KL02 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms