Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Rsrc2-208ENSMUST00000182309 1595 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sun1-201ENSMUST00000058716 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm13898-201ENSMUST00000141865 610 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 BB187690-201ENSMUST00000198619 1176 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Acsm5-204ENSMUST00000207387 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm6353-201ENSMUST00000223234 1051 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm43305-202ENSMUST00000225083 705 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 AC123533.3-201ENSMUST00000228056 454 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Tctex1d1-201ENSMUST00000030248 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Prss1-201ENSMUST00000031910 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Olfr578-201ENSMUST00000056235 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 H2-M10.4-201ENSMUST00000057502 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Siah1bQ06985 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Blk-201ENSMUST00000014597 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm42962-201ENSMUST00000201966 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm15373-201ENSMUST00000121495 214 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Stard6-206ENSMUST00000174118 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pkib-204ENSMUST00000175852 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm8707-201ENSMUST00000183325 980 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 AC154766.1-201ENSMUST00000226550 936 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Spata7-202ENSMUST00000101144 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Pcgf5-202ENSMUST00000071267 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm45895-201ENSMUST00000212248 1697 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Siah1bQ06985 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms