Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Sdc2-201ENSMUST00000022871 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Atxn7l1-212ENSMUST00000146040 2973 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 AC113125.1-201ENSMUST00000226852 1774 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Glp2r-201ENSMUST00000021289 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm26601-201ENSMUST00000181427 3551 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Dhx32-202ENSMUST00000063669 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Galns-201ENSMUST00000015171 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 D030055H07Rik-201ENSMUST00000143956 2712 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm42587-201ENSMUST00000198462 1981 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
GscQ02591 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
GscQ02591 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GscQ02591 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GscQ02591 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GscQ02591 Phf21a-205ENSMUST00000111291 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GscQ02591 Slc12a5-209ENSMUST00000202623 3574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
GscQ02591 AC133598.5-201ENSMUST00000224937 1517 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Cdyl-201ENSMUST00000075220 3470 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Tmem108-201ENSMUST00000049452 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Vps8-205ENSMUST00000118138 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Gm45289-201ENSMUST00000211048 2577 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
GscQ02591 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms