Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Adgrd1-201ENSMUST00000056617 5163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Atxn1-203ENSMUST00000180110 3901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Il18bp-202ENSMUST00000209368 2596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Fam13c-203ENSMUST00000173042 3310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13303-201ENSMUST00000117125 1284 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm12826-201ENSMUST00000121841 379 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11947-201ENSMUST00000125275 273 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm18801-201ENSMUST00000186616 536 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700052H01Rik-201ENSMUST00000196142 717 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC153363.1-201ENSMUST00000213572 359 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm8873-201ENSMUST00000217847 1439 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ppp6c-205ENSMUST00000204701 1495 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Zfp354a-201ENSMUST00000020628 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Serpinc1-201ENSMUST00000064725 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms