Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Bcas1-203ENSMUST00000109152 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Bmf-202ENSMUST00000110859 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rassf5-202ENSMUST00000068564 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ndst3-207ENSMUST00000172537 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Arhgap45-201ENSMUST00000043311 3499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rpgrip1-213ENSMUST00000181401 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm26805-201ENSMUST00000181885 3089 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 1700006J14Rik-203ENSMUST00000160091 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Mbd1-201ENSMUST00000097530 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Olfr287-204ENSMUST00000170618 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Sh3bp1P55194 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm27231-201ENSMUST00000185191 551 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Sh3bp1P55194 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms