Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Aoc1-203ENSMUST00000162948 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm42692-201ENSMUST00000199482 2833 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Mkl1-203ENSMUST00000131235 4222 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Akap3-203ENSMUST00000202878 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tsc1-201ENSMUST00000028155 7674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Btbd11-202ENSMUST00000105306 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Ttll8-201ENSMUST00000109371 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Prpf6-201ENSMUST00000002529 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Dcaf12l1-201ENSMUST00000060481 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Sez6l-203ENSMUST00000197425 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Rbm27-202ENSMUST00000091920 6266 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Edar-201ENSMUST00000003312 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.32
Vpreb1P13372 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lrp1b-207ENSMUST00000142688 2911 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ddr2-201ENSMUST00000027985 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pla2g4c-203ENSMUST00000108528 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Arpp19-205ENSMUST00000168166 3944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nrip3-202ENSMUST00000041460 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm37048-201ENSMUST00000194827 5578 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ambra1-202ENSMUST00000045705 5203 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Dusp3-203ENSMUST00000107173 4311 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm17473-202ENSMUST00000228544 2071 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Fam168a-205ENSMUST00000207875 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm10741-201ENSMUST00000218151 1748 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm10390-202ENSMUST00000181905 4269 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm16199-201ENSMUST00000160032 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Ndufab1-201ENSMUST00000033157 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Dnmt3b-207ENSMUST00000109771 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Kcnh6-201ENSMUST00000001965 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr686-202ENSMUST00000214147 2646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr686-203ENSMUST00000216143 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Hdac7-203ENSMUST00000116408 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Plk4-201ENSMUST00000026858 3479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Cpa4-201ENSMUST00000049251 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Vpreb1P13372 Timeless-205ENSMUST00000105244 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms