Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Usp28-203ENSMUST00000213874 4109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Tmod3-201ENSMUST00000072232 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Lrrc71-201ENSMUST00000023846 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Mycbp2-201ENSMUST00000159855 15233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rbmx-201ENSMUST00000098470 3107 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Parpbp-201ENSMUST00000048518 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rhof-204ENSMUST00000186469 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 9230112E08Rik-202ENSMUST00000189441 3352 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 D030047H15Rik-201ENSMUST00000148318 2536 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Olfr77-201ENSMUST00000057596 9649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Dhx30-215ENSMUST00000198425 3968 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm38340-201ENSMUST00000195039 4008 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Myo1e-201ENSMUST00000034745 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nebl-201ENSMUST00000028080 5780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 AC154220.1-201ENSMUST00000225033 1705 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Nfatc1-203ENSMUST00000167977 4604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm37582-201ENSMUST00000192953 1409 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Defa1P11477 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms