Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm44834-201ENSMUST00000206671 1396 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 5330411J11Rik-201ENSMUST00000137162 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm12932-201ENSMUST00000143705 620 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm17147-201ENSMUST00000164176 432 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Rbp2-204ENSMUST00000189446 803 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm45008-201ENSMUST00000206420 493 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Olfr654-202ENSMUST00000210457 1156 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC107711.6-201ENSMUST00000228455 1088 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 CT025630.3-201ENSMUST00000228798 835 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ctsj-201ENSMUST00000071526 1271 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm3327-201ENSMUST00000168906 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 4933405D12Rik-201ENSMUST00000180557 1383 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm9603-201ENSMUST00000165814 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm3542-201ENSMUST00000169362 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm13758-201ENSMUST00000118699 743 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm15932-201ENSMUST00000135068 535 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm12862-201ENSMUST00000150754 472 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Hoxb4P10284 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms