Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Nop2-201ENSMUST00000044200 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Rffl-201ENSMUST00000021036 1719 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm15476-201ENSMUST00000118247 1191 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 6030460B20Rik-201ENSMUST00000191764 1058 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm6859-201ENSMUST00000218614 989 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Rpl37-201ENSMUST00000045356 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 C130026L21Rik-204ENSMUST00000199587 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Sh3bgrl3-202ENSMUST00000105879 518 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Mir1190-201ENSMUST00000116925 96 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm15032-201ENSMUST00000118547 411 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm6500-201ENSMUST00000119412 451 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm16480-201ENSMUST00000120439 832 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Rian-208ENSMUST00000182370 352 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm29487-201ENSMUST00000190146 256 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 AC166902.2-202ENSMUST00000213191 1038 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 AC130217.1-201ENSMUST00000224146 909 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Rpl22l1-201ENSMUST00000043867 552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm4763-201ENSMUST00000081657 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Itgb1P09055 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms