Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sall2-201ENSMUST00000058326 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sncaip-203ENSMUST00000163742 3272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fgfr1-213ENSMUST00000167764 2915 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pex5l-204ENSMUST00000108224 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sh3kbp1-204ENSMUST00000112451 3914 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Xrcc5-201ENSMUST00000027379 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Masp2-202ENSMUST00000105701 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tomm40l-203ENSMUST00000111327 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm21874-202ENSMUST00000190315 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 BC017643-202ENSMUST00000106115 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Col4a4-201ENSMUST00000087050 10108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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H2-Eb1P04230 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Recql5os1-201ENSMUST00000134391 396 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Pmel-201ENSMUST00000054125 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Slco5a1-204ENSMUST00000136197 5123 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
H2-Eb1P04230 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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