Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Slirp-202ENSMUST00000160488 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Arpp19-207ENSMUST00000169188 216 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 H2al1a-201ENSMUST00000188439 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm18783-201ENSMUST00000220465 1151 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Fam3b-201ENSMUST00000049721 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm6378-201ENSMUST00000084199 444 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Apool-201ENSMUST00000026599 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Dtx3-205ENSMUST00000137151 346 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm43761-201ENSMUST00000202132 991 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm33570-201ENSMUST00000207608 1254 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm24146-201ENSMUST00000082760 321 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Syngap1F6SEU4 Vmn1r38-201ENSMUST00000226457 3462 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms