Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm4812-201ENSMUST00000182847 993 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ampd2-203ENSMUST00000102638 3650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ntm-202ENSMUST00000115236 1072 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 C920021L13Rik-201ENSMUST00000120398 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zbed5B2RPU8 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms