Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tmigd1-201ENSMUST00000072633 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
SrfQ9JM73 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Rpl10a-ps1-201ENSMUST00000120360 654 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Selenok-ps1-201ENSMUST00000125204 785 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gng2-203ENSMUST00000159073 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm29617-203ENSMUST00000186558 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 1700034K08Rik-202ENSMUST00000188082 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm31678-201ENSMUST00000198262 454 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm44809-201ENSMUST00000208305 993 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Gsdma3-202ENSMUST00000107508 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
SrfQ9JM73 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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