Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rmdn2-201ENSMUST00000040368 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Helz-201ENSMUST00000075012 6218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26815-201ENSMUST00000181200 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ccdc97Q9DBT3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ccdc97Q9DBT3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Utp6-201ENSMUST00000043152 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Ccdc97Q9DBT3 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Utp15-201ENSMUST00000040972 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm42633-201ENSMUST00000198853 2764 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26947-201ENSMUST00000182497 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Snd1-206ENSMUST00000167201 3781 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Rbbp6-201ENSMUST00000052135 6184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cd300lg-203ENSMUST00000107164 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 B020004J07Rik-202ENSMUST00000106919 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Gm26625-201ENSMUST00000181519 2538 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ccdc97Q9DBT3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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