Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Sulf2-202ENSMUST00000109249 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zmpste24-201ENSMUST00000058754 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ppfia1-202ENSMUST00000182226 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zadh2-201ENSMUST00000060223 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cemip-201ENSMUST00000064174 7111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Piwil1-202ENSMUST00000195959 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Alms1-201ENSMUST00000072018 9986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Lmbrd1-206ENSMUST00000191471 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zfr-201ENSMUST00000122941 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap36-201ENSMUST00000042444 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Zfp532-208ENSMUST00000182852 5476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 4930503B20Rik-201ENSMUST00000049703 2080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ube2f-203ENSMUST00000171165 5654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ncoa3-201ENSMUST00000088095 7531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ank1-215ENSMUST00000173248 7100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Il16-201ENSMUST00000001792 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-210ENSMUST00000182113 3553 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Atg16l1Q8C0J2 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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