Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm20616-201ENSMUST00000177262 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm37065-202ENSMUST00000192000 568 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Hbq1a-201ENSMUST00000020535 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm29783-201ENSMUST00000219398 369 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Npy-201ENSMUST00000031843 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ccr8-201ENSMUST00000048777 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Elobl-202ENSMUST00000082339 300 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm10530-201ENSMUST00000097514 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm14264-201ENSMUST00000147141 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Il18bp-203ENSMUST00000209844 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm37909-201ENSMUST00000193157 2159 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Airn-204ENSMUST00000160932 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 1700092M07Rik-201ENSMUST00000163172 380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rit1-207ENSMUST00000172252 820 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Kcne3-204ENSMUST00000179842 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tas2r141-ps4-201ENSMUST00000205072 946 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Olfr170-203ENSMUST00000218837 1008 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Figla-201ENSMUST00000032070 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Olfr170-201ENSMUST00000078603 1008 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm4925-201ENSMUST00000092231 397 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Olfr1229-201ENSMUST00000099788 1019 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cyp19a1-201ENSMUST00000034811 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Prune2-202ENSMUST00000223920 1803 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Prkd3-204ENSMUST00000119284 4743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm11401-201ENSMUST00000117212 344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm9578-201ENSMUST00000182354 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm7727-201ENSMUST00000219830 671 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC167234.1-201ENSMUST00000219929 279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 AC187103.1-202ENSMUST00000223904 1536 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Rpusd4-201ENSMUST00000034543 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Il1f5-206ENSMUST00000168941 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp54Q8BL06 Gm45440-201ENSMUST00000209826 1655 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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