Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm36028-202ENSMUST00000205931 1161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Armcx3-203ENSMUST00000086884 3488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm26658-201ENSMUST00000181067 2500 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Bzw2-201ENSMUST00000020856 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Gpr39-201ENSMUST00000027581 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Bex3-203ENSMUST00000113113 766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Dsg1bQ7TSF1 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Mak-203ENSMUST00000165087 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Dsg1bQ7TSF1 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Micalcl-203ENSMUST00000106645 2309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Dsg1bQ7TSF1 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms