Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Rhox10-201ENSMUST00000115150 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm25694-201ENSMUST00000175448 282 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm30652-201ENSMUST00000199103 430 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm18670-201ENSMUST00000218712 696 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pla2g2d-201ENSMUST00000030528 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gpa33-204ENSMUST00000166860 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gstm3-201ENSMUST00000004136 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Agbl4-203ENSMUST00000106587 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gm13413-201ENSMUST00000120953 602 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm14829-201ENSMUST00000121499 1138 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Mir3091-201ENSMUST00000175086 76 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm38004-201ENSMUST00000192972 357 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2010008C14Rik-201ENSMUST00000203956 593 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2900011O08Rik-201ENSMUST00000056521 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 2700099C18Rik-203ENSMUST00000182475 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Gm37144-201ENSMUST00000195445 1150 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 CAAA01125382.3-201ENSMUST00000215277 643 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprdQ64487 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprdQ64487 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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