Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cd300ld5-201ENSMUST00000100239 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cd300ld4-201ENSMUST00000100240 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm43452-201ENSMUST00000201873 991 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm44540-201ENSMUST00000205640 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Cd300ld3-201ENSMUST00000092459 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm19090-201ENSMUST00000218187 774 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm34983-202ENSMUST00000220432 494 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Gm8730-201ENSMUST00000076373 954 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp30Q3UN04 Mrps14-202ENSMUST00000097193 787 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms