Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Scp2-ps2-201ENSMUST00000072166 478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Eef1d-218ENSMUST00000154584 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Pilra-202ENSMUST00000110980 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gap43-201ENSMUST00000102817 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 G6pc-201ENSMUST00000019469 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm10408-201ENSMUST00000096168 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12962-201ENSMUST00000138697 580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm11513-201ENSMUST00000138855 751 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12257-201ENSMUST00000148244 585 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm5710-201ENSMUST00000183020 995 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm38839-201ENSMUST00000203833 633 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 AC155929.2-201ENSMUST00000218541 307 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Cryaa-206ENSMUST00000228716 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Cypt2-201ENSMUST00000041758 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Npm1-202ENSMUST00000093201 1192 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ces2a-204ENSMUST00000164182 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm12338-201ENSMUST00000122170 192 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm15499-201ENSMUST00000141390 422 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Plscr5-201ENSMUST00000179751 1191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mir6354-201ENSMUST00000184979 116 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm17868-201ENSMUST00000192761 668 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Olfr1535-201ENSMUST00000068163 981 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm4795-201ENSMUST00000095717 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm14147-202ENSMUST00000178211 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 9530056K15Rik-201ENSMUST00000061947 2315 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Ptprr-207ENSMUST00000155606 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Rhox12-202ENSMUST00000115146 561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Mir5114-201ENSMUST00000175574 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm15645-202ENSMUST00000183393 1299 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm8982-201ENSMUST00000184198 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm34237-201ENSMUST00000220575 1257 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 AC140244.1-201ENSMUST00000228454 229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm17026-201ENSMUST00000166674 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm17124-201ENSMUST00000168320 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Sult6b2-201ENSMUST00000111768 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Grin2bQ01097 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Grin2bQ01097 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms