Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 0610030E20Rik-201ENSMUST00000077783 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tbck-202ENSMUST00000169172 6578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Smok3a-202ENSMUST00000171498 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cipc-205ENSMUST00000187814 4098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Cipc-201ENSMUST00000038369 4098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pcdh15-231ENSMUST00000177107 5696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fam83c-201ENSMUST00000029143 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm15031-201ENSMUST00000121341 210 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Acss3-203ENSMUST00000165067 4696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Atp6v1e2-201ENSMUST00000065758 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Xrcc6-201ENSMUST00000069530 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Enthd1-201ENSMUST00000096347 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Ik-201ENSMUST00000007042 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Exoc7-203ENSMUST00000106413 3298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Bpifb2-201ENSMUST00000028983 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Supt20-ps-201ENSMUST00000117999 1560 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Fut10-201ENSMUST00000066173 3183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Zfp317-205ENSMUST00000215372 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
SbdsP70122 Il7-204ENSMUST00000194184 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms