Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Creb3l4-202ENSMUST00000107369 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Zfp672-201ENSMUST00000057836 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Urb1-203ENSMUST00000140920 7344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CartptP56388 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Babam2-201ENSMUST00000063813 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Dock4-204ENSMUST00000220912 7360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Slc22a14-204ENSMUST00000170400 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 AC154575.1-201ENSMUST00000227166 1474 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gm13498-201ENSMUST00000119159 2166 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CartptP56388 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 Stau2-216ENSMUST00000162627 2773 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 Cdcp2-201ENSMUST00000062495 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CartptP56388 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
CartptP56388 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
CartptP56388 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CartptP56388 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
CartptP56388 Pcdhga5-201ENSMUST00000193414 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms