Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 2310057M21Rik-201ENSMUST00000059438 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Zfp568-204ENSMUST00000177931 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.06
P18530 Gm28042-202ENSMUST00000129685 4472 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Smarcc2-201ENSMUST00000026433 4533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Atp7b-201ENSMUST00000006742 6505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 5730419F03Rik-201ENSMUST00000190504 2092 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Slc25a27-201ENSMUST00000024705 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Zfp42-201ENSMUST00000082120 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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P18530 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
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P18530 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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P18530 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
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P18530 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
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P18530 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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P18530 Ccdc87-201ENSMUST00000088653 3163 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 4930432K21Rik-201ENSMUST00000093375 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Eng-205ENSMUST00000167841 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
P18530 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
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