Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Zfp74-204ENSMUST00000108212 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Atf6F6VAN0 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ccdc15-202ENSMUST00000213633 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Scmh1-202ENSMUST00000064991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm37020-201ENSMUST00000195303 992 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm43066-201ENSMUST00000199589 1260 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Atf6F6VAN0 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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