Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 A930003O13Rik-202ENSMUST00000197486 3098 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Carmil1-202ENSMUST00000110398 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Nr2c1-201ENSMUST00000092213 2376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pcdh15-229ENSMUST00000155701 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 AC154431.1-201ENSMUST00000224910 880 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm38199-201ENSMUST00000192013 3277 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm15398-202ENSMUST00000219998 1477 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Gm37040-201ENSMUST00000191740 1824 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Prrt4B2RU40 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms