Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15570-201ENSMUST00000122093 625 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm16304-201ENSMUST00000129972 775 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14715-201ENSMUST00000156823 643 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm3116-201ENSMUST00000189440 1116 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm45060-201ENSMUST00000203293 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm28053-203ENSMUST00000204408 351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44767-201ENSMUST00000206634 469 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44659-201ENSMUST00000207269 436 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm36431-202ENSMUST00000209956 687 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm5130-201ENSMUST00000210233 959 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm29961-202ENSMUST00000215431 637 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm18873-201ENSMUST00000219517 1045 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cryaa-206ENSMUST00000228716 1117 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rpp30-201ENSMUST00000025714 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm46339-201ENSMUST00000222720 3539 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ing3-202ENSMUST00000115389 2546 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 4930511J24Rik-201ENSMUST00000223541 1528 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mettl18-201ENSMUST00000045694 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt2-202ENSMUST00000114861 1813 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43827-201ENSMUST00000200623 1390 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Phactr1-202ENSMUST00000110161 1950 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Tollip-203ENSMUST00000130439 1892 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15580-201ENSMUST00000121587 556 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15499-201ENSMUST00000141390 422 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Ube4bos2-201ENSMUST00000154000 317 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Smarce1-ps1-201ENSMUST00000180067 1077 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7160-201ENSMUST00000185535 471 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm2981-201ENSMUST00000213947 694 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rpl19-ps2-201ENSMUST00000219540 590 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 S100a10-201ENSMUST00000045756 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm4889-201ENSMUST00000075321 444 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gzmb-201ENSMUST00000015581 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Sertad4-201ENSMUST00000016406 3090 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Cd1d2-203ENSMUST00000194208 1527 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Igkv4-55-201ENSMUST00000103359 379 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm25763-201ENSMUST00000104099 129 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22661-201ENSMUST00000104192 132 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 E030025P04Rik-201ENSMUST00000106710 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b30-201ENSMUST00000108083 491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Apex2-202ENSMUST00000112719 969 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14278-201ENSMUST00000117381 878 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8817-201ENSMUST00000126769 693 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 A930019D19Rik-201ENSMUST00000135360 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15637-201ENSMUST00000135544 817 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
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