Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm37988-201ENSMUST00000155020 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Med21-201ENSMUST00000032429 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Picalm-201ENSMUST00000049537 3528 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm28195-201ENSMUST00000186992 372 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Tcstv1-202ENSMUST00000190512 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Otud1Q9CUB6 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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