Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ubap2l-203ENSMUST00000090908 3629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Btn2a2-204ENSMUST00000223877 2109 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Spert-201ENSMUST00000035243 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm14370-201ENSMUST00000122460 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm15273-201ENSMUST00000142302 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm7023-201ENSMUST00000147295 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm14357-201ENSMUST00000178352 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm14361-201ENSMUST00000178547 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm14348-201ENSMUST00000179183 868 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm3052-201ENSMUST00000186409 829 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Phf5a-201ENSMUST00000023117 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Smarcd2Q99JR8 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Gm8991-201ENSMUST00000073014 1075 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Foxr1-201ENSMUST00000098837 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Smarcd2Q99JR8 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Smarcd2Q99JR8 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Smarcd2Q99JR8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Smarcd2Q99JR8 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Klk13-201ENSMUST00000066834 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Mbtd1-206ENSMUST00000107854 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Gm44664-201ENSMUST00000206841 1786 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Tulp2-203ENSMUST00000107758 1597 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smarcd2Q99JR8 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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